على ابن عيسى كشته شد گفت بس كنيد كه من يك ماهى گرفته‌ام و خادم دو ماهى و بعد از آن عبدالرحمن انبارى را با سى هزار به جنگ طاهر فرستاد و در همدان مقابله اتفاق افتاد عاقبت بعد از صلح حربى واقع شد و عبد الرحمن كشته شد و هرثمة بن اعين نيز با سى هزار از پيش مأمون به مدد طاهر رسيد به اهواز و بصره رفته و گماشتگان امين را بيرون كرد به عزم تسخير بغداد روان شد و در سنه 197 طاهر و هرثمة و زهير بن مسيب بن طاهر به بغداد فرود آمدند و در تضييق اهل حصار كوشيدند و جميع اهل شهر از امين رو گردان گرديده به طاهر پيوستند تا شبى از شبهاى اوائل محرم در سنه 198 امين با كنيزكان و خويشان از شهر بيرون آمده كه به نزد هرثمة رود و او از مأمون امان به جهت امين بگيرد طاهر مطلع شده فرستاد او را گرفتند و در همان شب سر او را از بدن جدا كرده نزد مأمون فرستاد به مرو و مدت خلافت او چهار سال و هشت ماه بود و زمان حياتش بيست و هشت سال . و بعد از آن مأمون بن هارون بر سرير خلافت نشست چون در آخر محرم سنه 198 خبر قتل امين در مرو شايع شد خلايق دوباره تجديد بيعت مأمون كردند و امارت فارس و عراق و اهواز و حجاز و يمن را به حسن بن سهل داد و ذواليمينين را امر كرد تا به ضبط ولايت شام و جزيره و مغرب زمين و دفع بعضى از خوارج بپردازد ، و هرثمه را به خراسان طلبيد و چون مردم امارت حسن را مكروه داشتند مفاسد بسيار ظاهر شده و در سنه 199 محمد بن ابراهيم العلوى المعروف بالطباطبا به سعى ابوالسرايا خروج كرده و حسن با او محاربه نموده در همه حال حسن مغلوب شد و آخر الامر هرثمه از كرمانشاهان مراجعت نموده و ابوالسرايا را بكشت و محمد بن ابراهيم نيز فجأة در گذشت و از آنجا هرثمة به خراسان روان شد و در آنجا به سعى فضل بن سهل ذوالرياستين برادر حسن كشته شد و در آن وقت ابراهيم بن موسى بن جعفر در يمن مدعى خلافت شد و حسين أفطس علوى بر مكه مستولى شده و اعراب كوفه و بغداد با ابراهيم بن مهدى